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HEREDITARY DISEASE DETECTION遗传病检测

基因CNV变异验证(RT-PCR


拷贝数变异(Copy Number Variation,CNV)是由基因组发生重排而导致的,一般指长度为1kb以上基因组大片段的拷贝数增加或者减少,主要表现为亚显微水平的缺失和重复。CNV与人类许多疾病密切相关,在许多遗传疾病中扮演着重要的角色,特别是精神系统疾病、免疫系统疾病、罕见病及其他复杂疾病等。

       目前用于CNV检测的技术包含芯片技术、测序技术和PCR技术。虽然检测方法很多,但每一种方法都有自己的优缺点,实际应用需要根据具体情况选择适合的检测方法。

       多重连接探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)是目前国际上针对CNV的首选检测手段,其特异性、准确性都被公认满足临床检测的需求。但MLPA是一种靶向检测技术,仅能检测已知序列的拷贝数变化,且因为检测试剂盒的限制等原因,不是所有的基因都可以进行MLPA检测,这就会影响一些特定基因无法通过MLPA技术进行CNV的检测。

实时荧光定量PCR技术(real-time quantitative ploymerase chain reaction,RT-PCR)利用PCR反应体系中荧光基团的荧光信号变化,实时监测整个PCR进程中每一个循环扩增产物量的变化,通过Ct值和标准曲线的分析对起始模板进行定量或定性分析。
        
目前RT-PCR广泛应用于CNV的验证。该方法操作简单,经济实惠,不必设计复杂探针,检测关键为设计合适的引物,防止非特异性扩增,但 对引物特异性要求高,灵敏度相对较低。
方案选择情景:    
        
对于临床PANEL送检报告,常染色体隐性遗传基因发生单个位点杂合变异,且送检者临床症状与基因对应疾病OMIM临床表现相似,为临床送检的重点关注基因,临床高度怀疑有CNV的存在但MLPA技术无法实现CNV的检测,需要选择经济实惠的检测技术对该基因进行CNV验证,RT-PCR就是最合适的选择。

实例:LMNB1-ex9 CNV检测

MLPA检测结果

qPCR结果图示

通过计算得到其基因相对表达量≥1.3,结果为LMNB1-ex9重复,与MLPA结果一致。

    检测结果验证:
        
请与康旭医学检验所业务人员联系,核实样品情况,满足实验要求则不需要再次采血送检,可以直接检测。

    初次送检流程:
       1.
样本采集:由采血机构协助采集样本后后,交由康旭专业人员处理
       2.
样本接收:康旭专业人员协助派遣合作快递公司第一时间将您的样本送至康旭检验所
       3.
基因检测:收到样本后,进入检验流程
       4.
结果邮寄:检测结果严格保密,专人核对邮寄地址后,准确无误的送达到您的手中
       5.
报告咨询:专业的解读团队为您提供免费报告解读服务

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